Los orígenes más concretos de nuestra organización se remontan al gobierno de Alfredo González Flores (1914-1917), cuando se promulgaron en el país las primeras leyes tributarias.

En 1939 un grupo organizado de contadores formó la Facultad de Contabilistas Profesionales de Costa Rica.

En el período presidencial de Teodoro Picado (1944-1948) surgió la nueva Legislación Tributaria y con ella hubo mayor necesidad de profesionales en Contaduría.

Un grupo de contabilistas, encabezado por los señores Misael García Picado y Alfredo Zúñiga Pagés, redactaron un proyecto de Ley, el cual  fue enviado al Congreso y el 2 de marzo de 1951 se convirtió en la Ley número 1269, naciendo así el Colegio de Contabilistas de Costa Rica.

El 7 de junio de 1951 se celebró la primera Asamblea saliendo electo como presidente el contador Diómedes Astorga Sanabria. La cuota para los primeros colegiados fue de ¢5 (cinco colones).

En 1963 se compró el actual terreno de las instalaciones en Calle Fallas de Desamparados. Diez hectáreas con una casa de adobe tipo colonial, todo por la suma de ¢427.500, en tiempos del presidente Gonzalo Cháves Brenes.

En 1969 se cambió el nombre de Colegio de Contabilistas al de Colegio de Contadores Privados de Costa Rica, siendo el señor Edgar Rivera Bonilla el presidente de esta organización.

En 1982 se inauguraron las instalaciones administrativas en este lugar, cuando el presidente del país era Rodrigo Carazo Odio y el de nuestra organización el señor Orlando Castro Murillo. Se desocupó así el tercer piso de la antigua Farmacia Jara en avenida seis.

Para 1989 se creó el Fondo de Ayuda y Socorro Mutuo (FASMU), con el presidente Marco Rueda Quesada.

En 1991 nació el Instituto de Informática Contable, bajo la presidencia de don Eduardo Torres Mata, cambiando después su nombre a CECAP en el año 2000 en tiempos de don Ricardo Mora y luego a Fundacon en 2010, ya en la administración de don José Antonio Corrales Chacón.

Finalmente, el 11 de febrero de 2011 se firmó la escritura de derechos de operación de la Universidad del Contador, la cual será administrada por FUNDACON, acto que marca un hito en la historia de la educación latinoamericana, al ser uno de los pocos colegios profesionales en todo el continente en poseer una casa de enseñanza superior propia, todo esto durante la presidencia del señor Corrales Chacón.

60 años han pasado desde que a aquellos hombres visionarios un sentimiento de solidaridad para este gremio los cobijó. 60 años de luchas, de progreso pero ante todo de servicio a Costa Rica con sus treinta y un mil colegiados, siempre mirando hacia el futuro, promoviendo el desarrollo de la ciencia contable y protegiendo su ejercicio como profesión.